InputFieldには Hide Mobile Input という設定があります。これはモバイル環境では下の黄色の部分が表示されないようにするという設定です。

androidInput

しかしAndroidの場合、Unityのバグで Hide Mobile Input に設定していても表示されます。

自作のキーボードを作るしかないんでしょうか?昔からあるバグのようですので早く修正してもらいたいものです。

hideMobileInput

環境 Mac / OSX EI Capitan / Unity5.4.0b14